Ouvrages personnels :
Le Réel, Bordas, 1991.
Mathématiques et Existence, Champ Vallon, 1991.
Qu'est-ce que penser / calculer?, Vrin, 1992.
La Raison Systématique, Vrin, 1993.
Philosophie des Réseaux, P.U.F., 1993.
Cosmologie de L'Information, Hermès, 1994.
Ontologie Fantôme, Encre Marine, 1996.
Sciences exactes et Sciences humaines, Ellipses, 1997.
Les Grandes Révolutions Scientifiques du XXe siècle, P.U.F., 1997.
Météores, Essai sur le Ciel et la Cité, Champ Vallon, 1997.
La Conception Technologique, Hermès, 1998.
Mathématiques et métaphysique chez Paul Finsler, précédé de : Paul Finsler,
De la Vie après la Mort, Encre Marine, 1999.
Finale avec Fou (sur Le Joueur d'Echecs de Stephan Zweig), Editions du Temps, 2000.
L'Homme Volant, Champ Vallon, 2003; Multiples, Le Corridor Bleu, 2004.
Philosophie et Musique Contemporaine, Champ Vallon, 2006.
La Forme des Crises, logique et épistémologie, Champ Vallon, 2008.
Le cas du K2, Le Corridor bleu, 2010.
La fille qui dort au Céramique (et autres dialogues anti-platoniciens), Le Corridor Bleu, 2012.
Inventer le Masculin, Champ Vallon, 2013.
Coïncidences, Philosophie & Epistémologie du hasard, Le Corridor Bleu, 2015.
Mathématiques et Philosophie, des irrationnels aux motifs, Londres, Iste, 2017.
Mathematics and Philosophy, London, Wiley, 2018.
Antidote, Le Corridor Bleu, 2021.
Graphs, orders, infinites and philosophy, London,Wiley, 2023.
Graphes, ordres, infinis et philosophie, Londres, Iste, 2024.
En collaboration avec A. Micali et P. Anglès,
L'unification des mathématiques (algèbres géométriques, géométrie algébrique et philosophie de Langlands), Hermès-Lavoisier, 2012.
En collaboration avec P. Neuville,
Towards a General Theory of Classifications, Bäsel, Birkhaüser, 2013.
En collaboration avec P. Neuville,
Taxinomie et Réalité, vers une métaclassification, London, Iste, 2014.
Ouvrages collectifs :
Penser les Réseaux (sous la dir. de D. Parrochia), Champ Vallon, 2001.
Jean-Claude Beaune ou la technologie retrouvée (sous la dir. de D. Parrochia), Publications de la Faculté de Philosophie de Lyon, 2005.
Automates, Réseaux, Interfaces : sur l'oeuvre de G. Chazal (sous la dir. de J.-C. Beaune, F. Dagognet et D. Parrochia, Publications de la Faculté de Philosophie de Lyon, 2007.
La Forme de la Bibliothèque, Bible, bibliothèque et politique : sur l'oeuvre de R. Damien (sous la dir. de J.-C. Beaune, F. Dagognet et D. Parrochia), Publications de la Faculté de Philosophie de Lyon, 2009.
Regards philosophiques sur la cosmologie, (sous la dir. de A. Barrau et D. Parrochia), Dunod, 2010.
Formes, systèmes et milieux techniques (après Simondon), ss la dir. de D. Parrochia et V. Tirloni), Ed. Jacques André, 2012.
